SBDD(Structure-Based Drug Design)已被医药品业界持续使用25年以上。SBDD在药物发明、设计、以及最佳化的领域中,持续扮演重要角色。更进一步,随著高等生物物理学与计算处理方法之发展,SBDD对于靶物(hit)的确认,以及从靶物到前导 (hit to lead)化合物的最佳化方法,造成全体业界重大之影响。本次的议程之中,将焦点置于SBDD用于医药品化学、计算处理、生物物理学上之成功案例与最新发现。主办单位在此邀请各界,针对下列领域中之最新发现(尚未发表),出席会议进行研究发表。
- 各种案例学习:医药品化学家与模型专家共同谈论「在确认与发展靶物与前导化合物之候补时,SBDD所扮演之角色」
- 「Med Chem」之展望: 多重特性之最佳化,及其与SBDD相似之角色
- 化合物的物理化学特性、ADME特性之考察(ERG、以X光构造为基础之CYP例子)
- 活体外(in vitro)与活体内(in vivo)化合物之药理学特性之考察
- 化合物之设计:化学与生物学之结合
- 计算处理方法:
- 新计算处理方法与其利用: ab initio/QM的虚拟筛选、蛋白质柔软性之处理、同性模型、QSAR等
- 虚拟筛选与虚拟对位(docking)
-片段(fragment-based)筛选与DeNovo设计方法
- pharmacophore模型
- 蛋白质与配体(ligand)之相互反应
- 配体与标的之亲和性预测:自由能之计算・MM/PBSA・评分函数(scoring function)机能等
- implicit/explicit water模型之溶媒与效果
- 共有键结型抑制剂能带来什么新意?
- 蛋白质再重组能量与配体应变计算
- 键结site水分子之角色
- 前导化合物最佳化中,explicit water信息之利用
- 水对键结特异性之影响
- 将运动学数据使用于结构模型
- k_on以及k_off之重要性:调整 k_on或k_off来促进效力
- 运动行为之计算模拟
- 生物物理学方法之应用
- 蛋白质-配体、蛋白质-蛋白质复合体之构造确认: X光结晶・NMR
- 蛋白质与配体亲和性之判断: MS・SPR・NMR・ITC
- 新标的领域: 批准・可药性(drugability)
- SBDD的新方向: 膜结合性蛋白质・离子通道・GPCR